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分享|PCR實驗室污染后的處理措施

2022-03-07 作者(zhe): 瀏覽數:1165


  污(wu)染(ran),是(shi)(shi)PCR實(shi)驗(yan)(yan)(yan)室出現(xian)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)假陽性(xing)、結果(guo)不可信的(de)(de)(de)(de)(de)重要原因,PCR實(shi)驗(yan)(yan)(yan)室應(ying)當將防污(wu)染(ran)作為日常管理、實(shi)驗(yan)(yan)(yan)安排、清潔消毒、實(shi)驗(yan)(yan)(yan)習慣的(de)(de)(de)(de)(de)核(he)心。PCR 實(shi)驗(yan)(yan)(yan)污(wu)染(ran)和細胞(bao)污(wu)染(ran)是(shi)(shi)有差(cha)別的(de)(de)(de)(de)(de),PCR 實(shi)驗(yan)(yan)(yan)污(wu)染(ran)主要是(shi)(shi)核(he)酸而不是(shi)(shi)細菌(jun)和其他入侵者。因此所有的(de)(de)(de)(de)(de)預防措(cuo)施都會稍(shao)稍(shao)有所不同。“易(yi)查不易(yi)察”,污(wu)染(ran)來(lai)的(de)(de)(de)(de)(de)悄無聲息,我們該如(ru)何應(ying)對(dui)。今天給大家簡單介(jie)紹一(yi)下PCR實(shi)驗(yan)(yan)(yan)室的(de)(de)(de)(de)(de)主要污(wu)染(ran)來(lai)源、實(shi)驗(yan)(yan)(yan)中如(ru)何避免和減少污(wu)染(ran)的(de)(de)(de)(de)(de)可能性(xing)及實(shi)驗(yan)(yan)(yan)發生污(wu)染(ran)的(de)(de)(de)(de)(de)應(ying)急處(chu)理方案。

  PCR實驗室的污染來源

  1、樣本間交(jiao)叉(cha)污染:

  收集(ji)樣本(ben)(ben)的容器(qi)(qi)被污染(ran)或樣本(ben)(ben)密封不嚴外溢;不同(tong)樣本(ben)(ben)移液(ye)(ye)時(shi)(shi)忘記更換槍尖或未使用帶(dai)濾芯槍尖;移液(ye)(ye)器(qi)(qi)等實驗器(qi)(qi)具及耗材未及時(shi)(shi)消毒滅菌(jun);不同(tong)樣本(ben)(ben)同(tong)時(shi)(shi)開蓋(gai)或樣本(ben)(ben)劇(ju)烈震蕩(dang)、反復吹吸導致氣(qi)溶膠形成(cheng)擴(kuo)散,相互交叉污染(ran)。

  2、實(shi)驗試劑(ji)污染:

  主要是在 PCR 組分試(shi)劑加(jia)樣過程(cheng)中,由(you)于移(yi)液器(qi)、容器(qi)、陰性(xing)(xing)對照及其它(ta)試(shi)劑被核酸模板(ban)或陽性(xing)(xing)對照污(wu)染(ran)。 加(jia)樣過程(cheng)中,因為 PCR 試(shi)劑對溫(wen)度十(shi)分敏感,需(xu)要通過冰浴使得 PCR 試(shi)劑和 PCR 板(ban)/管處于 0℃,但這個過程(cheng)也是充滿了污(wu)染(ran)的風險的。

  3、擴增產(chan)物(wu)污染:

  大量(liang)拷(kao)貝(bei)的產物泄(xie)漏(lou)或擴增后的PCR反應(ying)管意外開(kai)蓋,這是 PCR 反應(ying)中最主要最常見的污染問題(ti)。因為 PCR 產物拷(kao)貝(bei)量(liang)大,遠遠高(gao)于 PCR 檢(jian)測數個拷(kao)貝(bei)的極(ji)限,所以極(ji)微量(liang)的 PCR 產物污染,就(jiu)可(ke)形成假陽性。

  4、克(ke)隆質粒(li)污染:

  作為陽性質控品的克隆質粒外溢。

  PCR實驗室的防污染方法

  按照實驗(yan)室(shi)的安(an)全(quan)(quan)工(gong)作制(zhi)度或安(an)全(quan)(quan)標準操作程序(xu),所有操作符合(he)《實驗(yan)室(shi)生(sheng)物安(an)全(quan)(quan)通用要求》(GB19489-2008)。

  1、嚴(yan)格(ge)執行各(ge)區功能(neng)劃分:

  試(shi)劑儲(chu)存和準備區:貯(zhu)(zhu)存試(shi)劑的(de)制備、試(shi)劑的(de)分裝和擴增反應混(hun)合液的(de)準備,以及(ji)離心(xin)管、吸頭等消耗品的(de)貯(zhu)(zhu)存和準備。

  標(biao)本制備區(qu):核酸(RNA、DNA)提取、貯(zhu)存及(ji)其加入(ru)至擴增反應管(guan)。對于涉及(ji)臨(lin)床(chuang)樣(yang)本的操作,應符合生物安全二級實驗室防護(hu)設(she)備、個人防護(hu)和操作規范(fan)的要求。

  擴增(zeng)區:cDNA合成(cheng)、DNA擴增(zeng)及檢測(ce)。

  擴增產物分析區(qu):擴增片段的進一步分析測(ce)定,如雜交、酶切電泳(yong)、變性(xing)高效液相分析、測(ce)序等。

  試劑(ji)準(zhun)備(bei)區(qu)、樣本制備(bei)區(qu)和擴增(zeng)區(qu)內(nei)的(de)實驗用(yong)品,包括移液器等器具應(ying)專用(yong),空氣(qi)、物品流向依次為:試劑(ji)準(zhun)備(bei)區(qu)、樣本制備(bei)區(qu)、擴增(zeng)區(qu)、產物分析區(qu),不(bu)可逆行。

  2、清(qing)潔的實驗用品:

  實(shi)驗室自配試劑(去離子(zi)水(shui)、緩沖液(ye)等)和(he)所有使(shi)(shi)用(yong)器具在使(shi)(shi)用(yong)之前均應(ying)高壓滅菌或(huo)紫外(wai)殺菌。槍尖、反應(ying)管等實(shi)驗耗材應(ying)一次性使(shi)(shi)用(yong)。

  3、正確的實驗操作:

  實(shi)驗應在(zai)超凈工作(zuo)臺(tai)內進(jin)行,工作(zuo)臺(tai)內應放置PCR專用的微量離心機、各量程的移液器和其(qi)他必需物品。

  實(shi)驗(yan)的(de)過程中(zhong)選擇最合適尺寸的(de)手(shou)套并能及(ji)時(shi)更換(huan),在進出不同實(shi)驗(yan)區域或進行模板操(cao)作后(hou)都(dou)應更換(huan)實(shi)驗(yan)服、口罩、帽子(zi)及(ji)手(shou)套,以避(bi)免不同實(shi)驗(yan)區交叉(cha)污染(ran)。

  裝有PCR試劑的反應管(guan)在打開之前應先(xian)瞬時離心,將管(guan)壁及管(guan)蓋上的液(ye)體離至管(guan)底(di),降低污染手套或(huo)加樣器(qi)的風(feng)險;謹慎(shen)開啟反應管(guan),防止管(guan)內液(ye)體濺出或(huo)形成氣溶膠導致污染。

  吸(xi)加試劑和模板(ban)的操作應嚴(yan)格按(an)照(zhao)規范要求(qiu)進(jin)行,遵守“慢吸(xi)快打”原則,盡(jin)量一次性(xing)完成,忌多次抽吸(xi),以避免氣(qi)溶膠(jiao)產生的交叉污染。

  PCR試(shi)劑建(jian)議小量分裝,以減少(shao)反(fan)復凍(dong)融、重復取(qu)樣次數;多樣本(ben)PCR反(fan)應時,先(xian)配制反(fan)應混合液分裝至(zhi)反(fan)應管(guan)中,最后加入樣本(ben)核酸,請勿同時開蓋,盡量保證單(dan)人單(dan)管(guan),實現完(wan)全閉管(guan)操作。

  實(shi)驗試(shi)劑應(ying)與樣品和PCR產物(wu)分開(kai)保存,不(bu)應(ying)放(fang)于同處。

  PCR擴增實驗完成后及(ji)時將反(fan)應(ying)管(guan)(guan)取出,用一次性(xing)手套將產物(wu)反(fan)應(ying)管(guan)(guan)包裹丟(diu)棄,保證管(guan)(guan)蓋緊閉。

  4、規范的實驗設計:

  應遵(zun)循實(shi)驗(yan)室內部質量控制的(de)相關規定,實(shi)驗(yan)中設立陽性(xing)對照、陰性(xing)對照和空白對照,全程(cheng)質控實(shi)驗(yan)過程(cheng),驗(yan)證PCR反應的(de)可靠性(xing),并協(xie)助(zhu)判斷擴增系(xi)統的(de)可信性(xing)。

  PCR實驗室的污染應急處理方法

  1、若核酸樣本溢出:

  立(li)即用(yong)(yong)布或紙巾覆蓋(gai),由外圍向(xiang)中(zhong)心傾倒10%的次(ci)氯酸(suan)消毒劑,約30分鐘后,清除污染(ran)物品,再用(yong)(yong)次(ci)氯酸(suan)消毒劑擦拭,并用(yong)(yong)75%酒精噴(pen)灑,移動紫外車定點照射1小時。

  2、其他不明情況污染:

  (1)暫停所有實驗操(cao)作;

  (2)清理(li)實驗(yan)室(shi)內所有物品,尋(xun)找污染(ran)來(lai)源;

  (3)加大(da)實驗室的通風;

  (4)對實驗(yan)室內所有表面(mian)(臺面(mian)、地面(mian)及(ji)墻面(mian)) 進(jin)行消毒;

  (5)75%酒(jiu)精(jing)空中噴霧;

  (6)開啟(qi)紫(zi)外消毒(du)裝置,延長紫(zi)外照射時間(4小時以上);

  (7)以(yi)上(shang)措施每日進(jin)(jin)行(xing),直至污染消除;用新(xin)試劑(ji)及確認無污染的器材進(jin)(jin)行(xing)原污染項目的試劑(ji)空白(bai)檢(jian)測(ce),連續3次均陰(yin)性后方可進(jin)(jin)行(xing)常(chang)規檢(jian)測(ce)。


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