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行業動態 行業動態

讓機器人做實驗而你在喝咖啡 多美好的事情

2014-12-11 作(zuo)者(zhe): 瀏覽數(shu):1379

  自(zi)動(dong)化(hua)(hua)和(he)(he)流水(shui)線早就成為現代工(gong)(gong)業生(sheng)產(chan)的主(zhu)要模式,但是(shi)科(ke)(ke)學(xue)實(shi)(shi)驗在自(zi)動(dong)化(hua)(hua)方(fang)面并不是(shi)那么(me)“先進”,許多(duo)實(shi)(shi)驗操(cao)作(zuo)(zuo)(zuo)都必須是(shi)人(ren)工(gong)(gong)操(cao)作(zuo)(zuo)(zuo),人(ren)工(gong)(gong)操(cao)作(zuo)(zuo)(zuo)一(yi)方(fang)面效率比較(jiao)低,另一(yi)方(fang)面也容(rong)易導致誤差,客觀(guan)上自(zi)動(dong)化(hua)(hua)實(shi)(shi)驗有存在的必要,另外隨著計算機和(he)(he)機器人(ren)技術(shu)水(shui)平的快(kuai)速(su)提升,也給自(zi)動(dong)化(hua)(hua)實(shi)(shi)驗提供(gong)了技術(shu)可能(neng)。現在美國(guo)一(yi)些公司已經(jing)給科(ke)(ke)學(xue)家提供(gong)這(zhe)種(zhong)自(zi)動(dong)化(hua)(hua)或半自(zi)動(dong)化(hua)(hua)實(shi)(shi)驗技術(shu)的服務(wu),相信隨著這(zhe)種(zhong)服務(wu)技術(shu)的提高,未來科(ke)(ke)學(xue)家完全有可能(neng)從具體的實(shi)(shi)驗操(cao)作(zuo)(zuo)(zuo)中解放出(chu)來。只要有研究經(jing)費和(he)(he)思路,機器人(ren)幫助科(ke)(ke)學(xue)家完成所有的實(shi)(shi)驗工(gong)(gong)作(zuo)(zuo)(zuo),甚至(zhi)數(shu)據(ju)分析(xi)。你(ni)只要將設計方(fang)案作(zuo)(zuo)(zuo)好,然后倒杯咖啡,等待者機器人(ren)給你(ni)完成實(shi)(shi)驗和(he)(he)分析(xi)報告,這(zhe)對科(ke)(ke)學(xue)家來說(shuo),這(zhe)是(shi)多(duo)么(me)美好的事情。  

  Max Hodak的(de)研(yan)究(jiu)主要是(shi)(shi)幫助科(ke)學(xue)家(jia)更方便(bian)收集研(yan)究(jiu)數據(ju),當(dang)在杜(du)克(ke)大學(xue)學(xue)習(xi)生物醫學(xue)工程專業的(de)時候,他(ta)(ta)就感到(dao)使(shi)用(yong)紙質實驗記(ji)錄(lu)本非常(chang)不(bu)方便(bian),研(yan)究(jiu)人(ren)(ren)員需要通過頁面(mian)搜索(suo)(suo)才能(neng)找到(dao)相(xiang)關數據(ju)。2008年,他(ta)(ta)將所有實驗記(ji)錄(lu)檢索(suo)(suo)輸入計(ji)算(suan)機,并(bing)編寫了一(yi)(yi)(yi)個計(ji)算(suan)機軟(ruan)件,用(yong)戶可方便(bian)地檢索(suo)(suo)到(dao)所需要的(de)內容(rong)。當(dang)時有人(ren)(ren)認(ren)為(wei)這是(shi)(shi)浪(lang)費時間,因為(wei)這個工作(zuo)不(bu)能(neng)發(fa)表論文。但是(shi)(shi)18個月后當(dang)他(ta)(ta)回(hui)到(dao)這個實驗室(shi)發(fa)現(xian)大家(jia)都非常(chang)喜(xi)歡(huan)使(shi)用(yong)他(ta)(ta)的(de)軟(ruan)件。這件事(shi)告訴他(ta)(ta)一(yi)(yi)(yi)個信息(xi),實驗室(shi)工作(zuo)也需要一(yi)(yi)(yi)些提(ti)高工作(zuo)效(xiao)率的(de)技術。他(ta)(ta)本人(ren)(ren)一(yi)(yi)(yi)直對如何(he)快速有效(xiao)分析實驗數據(ju)有興趣,于是(shi)(shi)考慮能(neng)不(bu)能(neng)在這方面(mian)做一(yi)(yi)(yi)些工作(zuo)?

  Hodak的(de)夢想是建(jian)立(li)一個(ge)自(zi)動化實(shi)驗(yan)(yan)室,這種實(shi)驗(yan)(yan)室能(neng)自(zi)動開(kai)展實(shi)驗(yan)(yan)、記(ji)錄實(shi)驗(yan)(yan)數據(ju)。他將這種實(shi)驗(yan)(yan)室命(ming)名未生(sheng)物數據(ju)中心。2012年他創辦了一個(ge)公司Transcriptic。這個(ge)公司成立(li)的(de)目的(de)是利用先進的(de)計(ji)算機軟件和機器人代替(ti)科學家開(kai)展繁瑣的(de)重復實(shi)驗(yan)(yan)操作,讓(rang)他們更(geng)容易獲得和分析研究(jiu)數據(ju),最終建(jian)立(li)更(geng)經濟更(geng)有效率也更(geng)具有重復性(xing)的(de)研究(jiu)模式(shi)。

  Transcriptic 和EmeraldTherapeutics兩家公司(si)共同致力于給科學家提供遠程實(shi)驗操作,許多大型生物(wu)實(shi)驗室已經(jing)具有自(zi)動(dong)化實(shi)驗設備,例如自(zi)動(dong)化測序(xu)儀(yi)等。他們希望能走的更遠,是將(jiang)(jiang)更多常規實(shi)驗如電泳和分(fen)離核酸蛋白分(fen)子,并將(jiang)(jiang)這種服務提供給各類生物(wu)實(shi)驗室。

  在(zai)Transcriptic的協(xie)助下,用(yong)戶可以使用(yong)實(shi)驗(yan)軟件(jian)操(cao)作(zuo)系統將(jiang)所有實(shi)驗(yan)步驟轉變成(cheng)機(ji)器(qi)(qi)識別語言,用(yong)戶訂單(dan)和任何(he)樣本(ben)都可送到Transcriptic,實(shi)驗(yan)根(gen)據(ju)(ju)用(yong)戶要求(qiu)在(zai)計算機(ji)控制(zhi)下自(zi)動完成(cheng),在(zai)不同機(ji)器(qi)(qi)之間機(ji)器(qi)(qi)人協(xie)助完成(cheng)PCR、讀(du)去數(shu)據(ju)(ju)、溶(rong)液添加(jia)、冰(bing)凍和孵育等常規操(cao)作(zuo)。用(yong)戶可在(zai)線實(shi)時獲(huo)得實(shi)驗(yan)數(shu)據(ju)(ju)。

  這種服務讓科學(xue)家從乏味(wei)的(de)實驗(yan)(yan)操作中(zhong)解放出(chu)來,節省(sheng)(sheng)的(de)時間可以專心用于閱(yue)讀(du)文獻、撰(zhuan)寫論(lun)文和申請經費。加州大學(xue)戴(dai)維斯分校合成生(sheng)物學(xue)家JustinSiegel正在設計(ji)制造一些新(xin)的(de)酶(mei),Transcriptic現在能開(kai)展分子生(sheng)物學(xue)實驗(yan)(yan),讓他的(de)學(xue)生(sheng)節省(sheng)(sheng)了大約(yue)1/3的(de)時間,尤(you)其是反復進行的(de)DNA克(ke)隆和突變方面的(de)工作。

  Siegel利用Transcriptic的服(fu)務完成了一(yi)種檢(jian)測橄欖(lan)油的生物傳感(gan)器的工(gong)作,完成這一(yi)工(gong)作的學生2014年11月(yue)3日獲得2014年國際基因工(gong)程(cheng)機器競(jing)賽(sai)大獎,由于效率(lv)提(ti)高,讓他們(men)有勇氣嘗試更多(duo)設計(ji)。

  Emerald公司正在(zai)檢驗(yan)Emerald云實驗(yan)室(shi),該技(ji)(ji)術(shu)將給科學(xue)家用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)提供一站(zhan)(zhan)式在(zai)線服(fu)務,用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)通過(guo)該系統能(neng)下(xia)實驗(yan)訂單、分(fen)析數(shu)據和(he)建(jian)立合作(zuo)關系。最早于2015年,試用(yong)(yong)(yong)用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)可(ke)以對(dui)40多種常規(gui)實驗(yan)技(ji)(ji)術(shu)下(xia)訂單,這些實驗(yan)包(bao)括westernblots蛋白分(fen)析、高(gao)壓液(ye)相分(fen)離目標成(cheng)分(fen)等。當實驗(yan)訂單下(xia)好后,技(ji)(ji)術(shu)人員(yuan)將在(zai)公司的自(zi)動化工作(zuo)站(zhan)(zhan)設計實驗(yan),操(cao)作(zuo)樣本盤在(zai)機器之間(jian)按照程(cheng)序傳(chuan)遞并按照程(cheng)序完(wan)成(cheng)實驗(yan)操(cao)作(zuo),用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)從云實驗(yan)室(shi)直接獲得研(yan)究(jiu)數(shu)據。利用(yong)(yong)(yong)云實驗(yan)室(shi),用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)可(ke)以試用(yong)(yong)(yong)文本功能(neng)分(fen)析實驗(yan)結果,也可(ke)以回顧所(suo)有的實驗(yan)過(guo)程(cheng),包(bao)括所(suo)有的機器和(he)試劑等信息,以及其他用(yong)(yong)(yong)戶(hu)(hu)授權公開的研(yan)究(jiu)數(shu)據。

  這種服務和(he)傳統(tong)的實驗類似,但是數(shu)據采集可更精確(que),可控性(xing)更強(qiang)。也(ye)許有(you)科學(xue)家擔心費用會(hui)不會(hui)很高,Hodak說他們提(ti)供的基因克隆和(he)突(tu)變和(he)普(pu)通實驗室的費用相當,甚至更便宜(yi),考慮到穩定性(xing)和(he)人工(gong)費用,最(zui)終(zhong)可以減少50%的費用。

  當然作為新生事物(wu),有不(bu)少(shao)人(ren)觀(guan)望和懷疑,而且由(you)于目前技術的(de)(de)限制,也不(bu)是所有的(de)(de)實驗操作都能實現自動化。另外(wai)一個大的(de)(de)問(wen)題(ti)室設備之間的(de)(de)兼容性(xing)和通訊障(zhang)礙問(wen)題(ti)。

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