下一代測序(xu)(xu)(NGS)技術使快(kuai)速(su)讀取(qu)患者DNA中(zhong)成(cheng)千上萬的堿基(ji)序(xu)(xu)列成(cheng)為了可能，NGS的快(kuai)速(su)崛起為遺傳(chuan)診斷開啟了一個嶄新的時(shi)代。然(ran)而，新技術的發展也帶來(lai)了巨(ju)大的挑(tiao)戰(zhan)，包括技術水平、數(shu)據管理和檢測結果的解(jie)釋與咨詢三(san)方面帶來(lai)的挑(tiao)戰(zhan)。將(jiang)NGS數(shu)據應用于診斷領(ling)域之前(qian)，尚且還有(you)很多問題(ti)需要解(jie)決(jue)。
在這種背景(jing)下，EuroGentest和歐盟人類遺(yi)傳(chuan)學(xue)會對基于NGS的遺(yi)傳(chuan)病診斷(duan)進(jin)行(xing)評(ping)估和驗(yan)證(zheng)，并制定了NGS診斷(duan)指南(nan)。該指南(nan)經過實驗(yan)室遺(yi)傳(chuan)學(xue)家、生物(wu)信息學(xue)家、臨床遺(yi)傳(chuan)學(xue)家、企業界和患(huan)者代表及(ji)其他(ta)人類遺(yi)傳(chuan)領域相關(guan)人員的共同(tong)討論，最終由實驗(yan)室遺(yi)傳(chuan)學(xue)家和生物(wu)信息學(xue)家制定。該指南(nan)可做為補充(chong)材料，幫(bang)助(zhu)診斷(duan)實驗(yan)室有效應用NGS技術并指導NGS的資質認證(zheng)。
該指(zhi)(zhi)南主要(yao)針(zhen)對罕見(jian)病和單基因(yin)疾病的(de)NGS診斷，主要(yao)專注于(yu)基因(yin)panels的(de)靶向分(fen)(fen)析、特(te)定的(de)捕獲分(fen)(fen)析以及從(cong)全外顯子測(ce)序(xu)中提取可用數據。理論上(shang)或許(xu)很快(kuai)就能(neng)從(cong)全基因(yin)組測(ce)序(xu)中提取類(lei)似的(de)信息(xi)，在這種情況下，該指(zhi)(zhi)南將仍適用，但由于(yu)全基因(yin)組測(ce)序(xu)還(huan)能(neng)檢(jian)測(ce)到其(qi)他疾病的(de)分(fen)(fen)子特(te)性(xing)，因(yin)此測(ce)序(xu)深度(du)應當(dang)相應延長。該指(zhi)(zhi)南涵蓋了過(guo)去幾年關于(yu)NGS的(de)指(zhi)(zhi)導方針(zhen)，但比舊版多了一(yi)些新見(jian)解，其(qi)中最(zui)重要(yao)的(de)新特(te)性(xing)是NGS診斷測(ce)試的(de)“評價系統”。
該指(zhi)南(nan)(nan)在三(san)次(ci)NGS與診(zhen)斷(duan)的(de)重大討(tao)論(lun)會(hui)(hui)(hui)中生成(cheng)。第(di)(di)一次(ci)研(yan)討(tao)會(hui)(hui)(hui)于2013年(nian)2月(yue)25日-26日在比利Leuven舉行，2013年(nian)3月(yue)7-8日在EuroGentest科學大會(hui)(hui)(hui)上NGS指(zhi)南(nan)(nan)初步(bu)意見形(xing)成(cheng);第(di)(di)二次(ci)討(tao)論(lun)會(hui)(hui)(hui)于2013年(nian)10月(yue)1日-2日在Leuven舉行，主(zhu)要對NGS診(zhen)斷(duan)指(zhi)南(nan)(nan)進(jin)行編(bian)寫，2013年(nian)11月(yue)21日-22日在Nijmegen敲(qiao)定該指(zhi)南(nan)(nan);第(di)(di)三(san)次(ci)討(tao)論(lun)會(hui)(hui)(hui)中，邀(yao)(yao)請了更多(duo)的(de)相(xiang)關人(ren)員參與，他們被邀(yao)(yao)請對指(zhi)南(nan)(nan)進(jin)行評論(lun)并作(zuo)評述報告，指(zhi)南(nan)(nan)出版前(qian)遞交歐洲(zhou)人(ren)類遺(yi)傳學董事會(hui)(hui)(hui)審核，最終該指(zhi)南(nan)(nan)于2015年(nian)7月(yue)正式通過審批并刊出，并獲(huo)得了基因診(zhen)斷(duan)聯盟的(de)高度稱贊，對歐洲(zhou)NGS診(zhen)斷(duan)產業的(de)質量監督有重要意義。
該指南從目前(qian)發展水平、診斷/臨床的效(xiao)用、知情(qing)同意(yi)書及對患者和醫(yi)生的通(tong)知、驗證、報告、研究與診斷之間(jian)的區別六個方(fang)向做(zuo)了38個聲明，并發表(biao)于(yu)《歐洲人類遺傳學雜(za)志》上。
一、目前發展水平
從(cong)某(mou)種意義上說，由于技術發(fa)展迅猛導致了(le)NGS平(ping)臺出(chu)現(xian)不穩定的(de)現(xian)狀。然而，這不能(neng)作(zuo)為阻止(zhi)NGS應(ying)用于診斷(duan)領域(yu)的(de)理(li)由，因(yin)為NGS給患(huan)者(zhe)帶來(lai)了(le)潛在的(de)利益。阻止(zhi)NGS過早用于診斷(duan)的(de)原因(yin)只能(neng)是其質量差，未通過驗證(zheng)就進入臨床(chuang)診斷(duan)對(dui)患(huan)者(zhe)而言具(ju)有威脅性，同時也(ye)是不可(ke)接受(shou)的(de)。
聲明1：未根據最新指南要求進行可接受性驗證測試，NGS不應進入臨床實踐中。
診(zhen)斷(duan)(duan)測(ce)試(shi)的(de)(de)目的(de)(de)是(shi)(shi)排除(chu)(chu)還是(shi)(shi)確(que)認(ren)診(zhen)斷(duan)(duan)應事先定義好，因為排除(chu)(chu)和確(que)診(zhen)的(de)(de)區(qu)別很(hen)重要，這種區(qu)別主要取(qu)決于測(ce)試(shi)的(de)(de)完整性和授權性，不(bu)僅(jin)僅(jin)涉及測(ce)試(shi)技術的(de)(de)不(bu)同設置(zhi)還包括診(zhen)斷(duan)(duan)的(de)(de)不(bu)同意見。
聲明2：實驗室必須確定即將進行的測試是用于排除診斷還是證實診斷。
二、診斷/臨床的效應
NGS應(ying)用于診(zhen)斷領(ling)域最大的(de)優勢是可在相對(dui)短(duan)的(de)時間內和相對(dui)低的(de)成本下檢測(ce)多個基因，從而(er)(er)得(de)出(chu)更(geng)多的(de)分子診(zhen)斷信(xin)息。NGS的(de)局限(xian)性在于其對(dui)平臺(tai)及濃縮方法的(de)依賴，且一直(zhi)以來(lai)認為濃縮方法和測(ce)序平臺(tai)容易受影響，因而(er)(er)額外(wai)的(de)測(ce)試對(dui)高質(zhi)量診(zhen)斷來(lai)說很重要。
聲明3：測試或分析的目的和實用性必須在驗證起始時進行討論，且驗證報告中應包括摘要總結。
診(zhen)斷的(de)效率(lv)必須明確，因為(wei)致病(bing)變異的(de)概(gai)率(lv)被標識了才能做出相(xiang)應(ying)的(de)分子診(zhen)斷。這個概(gai)率(lv)值由病(bing)人群為(wei)單位進行計算，從臨床角度確定了NGS的(de)性能，是(shi)反應(ying)測試效率(lv)和(he)臨床應(ying)用的(de)很好(hao)指標。
聲明4：當診斷實驗室考慮引進NGS監測時，首先必須考慮它的診斷效率。
在實(shi)踐中(zhong)，診(zhen)斷實(shi)驗室將提供更好的(de)基因(yin)panels，在開發診(zhen)斷測試(shi)時必須(xu)確定將一個基因(yin)移植到panels上(shang)所需的(de)條件。在理(li)想(xiang)情況(kuang)下，該問(wen)題應(ying)以多學科的(de)方式(shi)進行(xing)一級處理(li)，目標是(shi)編譯用(yong)于診(zhen)斷的(de)基因(yin)列(lie)表。
聲明5：出于診斷目的，只有異常基因型和與病理相關的已知基因(發表或證實過的)才能納入分析中。
一直以來人們都將(jiang)與身理(li)(li)缺陷相關基(ji)因(yin)(yin)稱為“核心基(ji)因(yin)(yin)”，從Sanger技術發展NGS技術，測(ce)(ce)(ce)序的(de)靈敏度(du)不(bu)應降(jiang)低。例如BRCA1和(he)BRAC2基(ji)因(yin)(yin)，Sanger測(ce)(ce)(ce)序技術結合缺失/重(zhong)復分析(xi)可使靈敏度(du)達99%，以此類推(tui)該方法對其他基(ji)因(yin)(yin)的(de)診斷(duan)效(xiao)率(lv)也應該很高。理(li)(li)論(lun)上增(zeng)加其他基(ji)因(yin)(yin)的(de)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)會增(zeng)加診斷(duan)率(lv)，但不(bu)應以犧牲原有的(de)突變檢(jian)測(ce)(ce)(ce)為代(dai)價。檢(jian)出率(lv)的(de)提高是決定核心基(ji)因(yin)(yin)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)列(lie)表和(he)處理(li)(li)缺口的(de)關鍵因(yin)(yin)素。
聲明6：出于比對，為了避免不負責任的測試，為了患者的利益，“核心疾病基因列表”應由臨床和實驗室專家制定。
若不(bu)(bu)考慮本(ben)指(zhi)南，實(shi)(shi)驗(yan)室可用(yong)不(bu)(bu)同(tong)參(can)數的(de)(de)NGS檢測(ce)(技術和診斷)。事實(shi)(shi)上，有太多的(de)(de)變量(liang)無法通過(guo)固定的(de)(de)指(zhi)南來(lai)指(zhi)導檢測(ce)。因此(ci)我(wo)們為NGS檢測(ce)提出一個簡單的(de)(de)評分系(xi)統(tong)，該(gai)系(xi)統(tong)可公平打分并對不(bu)(bu)同(tong)實(shi)(shi)驗(yan)室提供的(de)(de)NGS檢測(ce)進(jin)行簡單比對。
A類檢測(ce)：實驗室保證(zheng)編碼區和內含(han)子區序(xu)列(lie)的(de)(de)可(ke)靠內參或識(shi)別變體大于99%，并用(yong)Sangger測(ce)序(xu)(或其(qi)他互(hu)補(bu)的(de)(de)測(ce)序(xu)分析(xi))進行缺口填(tian)補(bu)，根據(ju)所使用(yong)的(de)(de)平臺(tai)，選擇額外的(de)(de)分析(xi)，如進行均(jun)聚物延伸(shen)的(de)(de)分析(xi)。
B類檢測(ce)：實驗室能(neng)正(zheng)確描(miao)述哪些(xie)區(qu)域能(neng)在(zai)可靠內參或(huo)識別變體大于(yu)99%的條件下測(ce)序，并(bing)用Sangger(或(huo)其(qi)他)測(ce)序方法進(jin)行缺(que)口填補。
C類(lei)測試：C類(lei)測試僅(jin)僅(jin)基于NGS的試驗(yan)，沒有(you)額(e)外的Sangger(或其他)測序試驗(yan)。
聲明7：簡單的評分系統基于檢測覆蓋面和診斷率，可對不同實驗室提供的檢測進行比較。
三、知(zhi)情(qing)同意書及(ji)對(dui)患者和(he)醫生的(de)通知(zhi)
基(ji)于NGS的(de)診斷取決(jue)于實(shi)驗室所(suo)用的(de)程序、平(ping)臺、數據(ju)過濾(lv)和數據(ju)儲存。至關重要的(de)是，咨詢(xun)醫生應當被(bei)完全告(gao)知檢測的(de)局(ju)限性(xing)及檢測可能出現的(de)不良(liang)影響。
聲明8：實驗室提供的每個NGS檢測應明確以下幾點：明(ming)(ming)確(que)(que)目(mu)標(biao)疾病，明(ming)(ming)確(que)(que)所(suo)(suo)檢(jian)測的基(ji)因名(ming)稱，明(ming)(ming)確(que)(que)可報告范圍(wei)，明(ming)(ming)確(que)(que)分析敏(min)感度(du)和特(te)異性(xing)，如(ru)果可以，還應(ying)明(ming)(ming)確(que)(que)與(yu)臨(lin)床表型無關但與(yu)所(suo)(suo)檢(jian)測的基(ji)因相關的疾病。
NGS診斷的(de)應用性(xing)主要依賴于直觀結果和二(er)次結果。盡管直觀結果可從與(yu)檢(jian)測(ce)疾(ji)病相(xiang)關的(de)基(ji)因信息中獲得(de)，但二(er)次結果卻(que)隱藏在與(yu)檢(jian)測(ce)疾(ji)病無關的(de)疾(ji)病基(ji)因中。
聲明9：診斷實驗室的分析途徑應聚焦于處于調查研究中的基因pannel以避免二次結果的發生，并進行相應的驗證。
直觀結(jie)果在基因pannel中的(de)概率(lv)很低(di)，一般(ban)依賴于疾病(bing)基因。然而(er)，檢測(ce)結(jie)果還(huan)有(you)可(ke)(ke)能反(fan)映出隱(yin)性(xing)雜(za)合突變，根據此還(huan)可(ke)(ke)判斷疾病(bing)的(de)攜帶狀況。這將對后(hou)續的(de)咨詢(xun)、生(sheng)育選擇等產(chan)生(sheng)影響。
聲明10：實驗室應該提供直觀結果的信息。
在執行NGS診斷檢(jian)測(ce)(ce)(ce)之前，臨床(遺傳)中(zhong)心(xin)需要建立(li)一(yi)個(ge)“直觀(guan)結(jie)果(guo)和二次結(jie)果(guo)的(de)協議(yi)”，該協議(yi)必(bi)(bi)須(xu)(xu)與倫理委員(yuan)會的(de)意見相符，應明確——在實(shi)驗(yan)室(shi)、研究所或(huo)國家層(ceng)面上——除了最初的(de)診斷結(jie)果(guo)，患者(zhe)對檢(jian)測(ce)(ce)(ce)出來(lai)的(de)額外結(jie)果(guo)的(de)告知(zhi)是否有選(xuan)擇決定權，還應詳(xiang)細說(shuo)明檢(jian)測(ce)(ce)(ce)直觀(guan)結(jie)果(guo)與疾病攜帶狀況是否出現在檢(jian)測(ce)(ce)(ce)報告中(zhong)。實(shi)驗(yan)室(shi)必(bi)(bi)須(xu)(xu)確保能妥善(shan)管(guan)理協議(yi)中(zhong)的(de)每一(yi)條(tiao)選(xuan)項。
聲明11：關于與目標疾病無關的其他疾病攜帶狀態和二次結果是否被告知的選項協議，如果臨床(chuang)中心(xin)或實驗(yan)室決定為患者提供，那么該協議(yi)應該包含所有的邏輯(ji)性。
此外，檢測(ce)前遺傳咨詢(xun)是必(bi)要(yao)的，且應包括預期結果(guo)(guo)和潛在的直觀結果(guo)(guo)與(yu)二(er)次(ci)結果(guo)(guo)的討論，并提供足夠的信(xin)息。
聲明12：應讓患者清楚當地對直觀結果與二次結果的管理政策。
聲明13：建議給患者提供一份書面說明書或在線可用信息說明。
四、驗證
樣(yang)品的質量(liang)(liang)與(yu)許多(duo)參數(shu)(shu)有關，包(bao)括數(shu)(shu)據(ju)的產量(liang)(liang)、PCR拷(kao)貝和覆蓋的比(bi)例。在診斷設置中，只有好的樣(yang)本才是必須分(fen)析的，因(yin)此對高(gao)質量(liang)(liang)的目標基因(yin)pannel、外顯子或基因(yin)組(zu)的標準定義十分(fen)必要。
聲明14：應準確描述診斷程序中所有的NGS質量測量指標。
NGS技術要(yao)求(qiu)監測特定的(de)run和特定分析/樣本的(de)特性(xing)。監測數據無需做成報告但可用于后續的(de)驗證。
聲明15：診斷實驗室應對平臺、所有的分析和所有的樣本設置一個相關質量度量結構化數據庫。
由于NGS工(gong)作(zuo)流程非常復雜，因此應(ying)建(jian)立樣本(ben)的(de)追蹤方法，包括在(zai)實驗室和計(ji)算分析中實施并聯(lian)法。
聲明16：在評估分析處理中包括平臺驗證過程應建立樣本追蹤方法和設置樣本識別條形碼。
在平(ping)臺(tai)驗證過程(cheng)中，實驗室必(bi)須確(que)保(bao)所有的設備(bei)和試劑都與制造(zao)商的要求相符。必(bi)須明確(que)每(mei)種(zhong)技術(shu)的局限性，并在開發測試和數據(ju)分(fen)析中將其考慮在內。實驗室必(bi)須能區(qu)分(fen)附屬于平(ping)臺(tai)、特(te)殊(shu)檢測或分(fen)析流程(cheng)的特(te)性。
聲明17：平臺驗證應包括精準度和精密度，且通過驗證的平臺工作結果無需其他方法來重復驗證。
顯然每種測序(xu)技術都(dou)存(cun)在著優缺(que)點，生物信息學(xue)工具必須能反(fan)映這些特征。
聲明18：生物信息學流程必須針對所使用的技術平臺。
在流程的(de)驗證期間，診(zhen)斷規范必須(xu)通過(guo)敏感(gan)和特性的(de)分析(xi)評估。例如，SNP檢測最佳化(hua)的(de)算法對(小片段)插入/刪除的(de)檢測準確性不(bu)高(gao)。實驗室必須(xu)證實意(yi)識(shi)到這些特性以(yi)及所使用的(de)變異(yi)檢測流程能滿足當前診(zhen)斷分析(xi)。
聲明19：在不同的流程驗證中，必須為每種類型的變異建立敏感性和特異性分析。
任何化(hua)學(xue)成(cheng)分(fen)(fen)的(de)改(gai)變(bian)、濃(nong)縮方法(fa)或生物信(xin)息學(xue)分(fen)(fen)析平臺應該(gai)保證后續的(de)有效性。
聲明20：診斷實驗室必須驗證所有的生物信息學流程(公用工具或商業軟件包)的標準信息設置，以確保相關數據更改后(新版本)及時跟進。
包含所(suo)有(you)相(xiang)關變(bian)異的本(ben)地數據庫提供(gong)了識別特定工作平臺的工件、跟蹤(zong)驗證結果、提供(gong)特異性(xing)位點數據和meta-分析交(jiao)換代理(exchange proxy)的重(zhong)要(yao)工具。通(tong)常這(zhe)個數據庫應允許進一步注釋(假(jia)陽性(xing)、已(yi)知(zhi)突變(bian)、隔離變(bian)體等)，這(zhe)將大(da)大(da)簡化診斷過程。
聲明21：診斷實驗室應使用當前注釋相關變異體的結構化數據庫。
數(shu)據(ju)存(cun)(cun)(cun)儲(chu)應(ying)使用標準的(de)開放(fang)性格(ge)式如FASTQ、BAM或VCF，這些格(ge)式的(de)數(shu)據(ju)可(ke)(ke)與其他實驗室共享。當存(cun)(cun)(cun)儲(chu)分(fen)析結果時，應(ying)額(e)外保存(cun)(cun)(cun)完整(zheng)的(de)日志文件。日志文件應(ying)盡可(ke)(ke)能(neng)完整(zheng)以(yi)保證FASTQ數(shu)據(ju)轉換為整(zheng)個診斷(duan)報告的(de)可(ke)(ke)復寫性。遺憾(han)的(de)是，關于如何(he)存(cun)(cun)(cun)儲(chu)目前國際上(shang)還沒有共識。然而，存(cun)(cun)(cun)儲(chu)必須符(fu)合國家的(de)需求和常識。
聲明22：診斷試驗必須對所有相關數據的長期存儲采取相應措施。
在(zai)啟動任何試驗(yan)之前，必須確定好臨床(chuang)目標(biao)(包括編碼區和保守的(de)剪(jian)接位點(dian))，臨床(chuang)目標(biao)取決于診斷測(ce)試與所定義的(de)基因pannel。
聲明23：可報告范圍必須在測試開發過程中確定，且對臨床醫生具有可用性(報告或傳達數字)。
聲明24：“可報告范圍”的要求取決于診斷分析的目的。
例如(ru)，外(wai)顯子(zi)測序分(fen)析的(de)目(mu)的(de)是(shi)獲得高效率的(de)診斷(duan)(duan)，不需要進行額(e)外(wai)分(fen)析來獲取所有基因組所覆蓋(gai)的(de)信息(xi)，但需要與臨床醫生清(qing)晰溝通這(zhe)種(zhong)測試方法不能用(yong)于排(pai)除特(te)定的(de)臨床診斷(duan)(duan)。診斷(duan)(duan)測試必(bi)須進行準確性(xing)、靈敏(min)性(xing)和(he)特(te)異性(xing)的(de)分(fen)析評估。原則(ze)上，這(zhe)些評估并不是(shi)新穎的(de)，且被(bei)認為很麻(ma)煩，但ISO標準對(dui)其的(de)要求(qiu)十分(fen)嚴格。
聲明25：當測試發生重大變化時，必須對質量參數進行檢查，且必須重新上樣檢測。實驗室應事先定義好當測試方法更新或升級后哪種類型的樣本要重新分析及分析次數。
五、報告
NGS檢測(ce)結(jie)果報告(gao)的(de)清晰性(xing)和(he)一致性(xing)至關(guan)重要，因(yin)為實驗室(shi)的(de)報告(gao)可能被(bei)專(zhuan)家(jia)和(he)非(fei)專(zhuan)家(jia)閱(yue)讀。從實用的(de)角度來看(kan)，臨床上的(de)重要結(jie)論、相關(guan)測(ce)試和(he)測(ce)試質量數據應寫在報告(gao)的(de)首頁。
聲明26：NGS的分析報告應該對患者的鑒別診斷進行總結，簡要描述測試，總結結果，將主要結果放于報告首頁。
所有致(zhi)病(5類(lei))或可能致(zhi)病(4類(lei))的變異必(bi)須(xu)包含在報(bao)告(gao)中，由(you)當(dang)地政策決(jue)定是否報(bao)告(gao)未分(fen)類(lei)的變異(UVs-3類(lei))，且實驗室科學家及臨床醫生必(bi)須(xu)清楚UVs-3類(lei)。
聲明27：關于基因變異報告的當地政策(符合國際建議)應由實驗室在分析之前建立和制定。
聲明28：必須收集UVs數據，最終目的是將這些變異體進行分類。
需發起收集和分享可用信息的群體(ti)活動，最終目(mu)的是將變異體(ti)絕(jue)對分類(lei)為致病性(5類(lei))或(huo)良性(1類(lei))。被(bei)實(shi)驗室或(huo)研(yan)究所采納的與直接結(jie)果和二次(ci)結(jie)果相關的政策必須體(ti)現在(zai)實(shi)驗室的實(shi)踐和報告中。
聲明29：在啟動檢測之前，實驗室應有一個關于訪問直接結果和二次結果的明確協議。
診斷(duan)(duan)實驗(yan)(yan)室不應(ying)該因(yin)舊數據的分析請(qing)求而超載(zai)。診斷(duan)(duan)請(qing)求應(ying)是包含合(he)(he)適(shi)(shi)時間(jian)與合(he)(he)適(shi)(shi)地點的合(he)(he)同，診斷(duan)(duan)試驗(yan)(yan)只能在給定的時間(jian)提供已知的和經過驗(yan)(yan)證的信息。
聲明30：一般情況下實驗室不會系統性地重分析舊數據并生成新報告，即使與疾病相關的核心基因發生了變化。
但在(zai)特殊情形下(該(gai)情形由疾病(bing)的(de)實驗(yan)室或社(she)區(qu)專家(jia)決定，如變(bian)(bian)(bian)體(ti)類型發生(sheng)變(bian)(bian)(bian)化時)，實驗(yan)室有(you)責任重新(xin)(xin)分析數據(ju)(ju)，在(zai)新(xin)(xin)證據(ju)(ju)的(de)基礎上(shang)生(sheng)成新(xin)(xin)報告，并重新(xin)(xin)聯系(xi)(xi)相關臨床醫生(sheng)和患者，告知(zhi)變(bian)(bian)(bian)異(yi)新(xin)(xin)狀態可能帶(dai)來(lai)的(de)影響，這(zhe)種情況下，建立病(bing)人(ren)與(yu)變(bian)(bian)(bian)異(yi)體(ti)的(de)有(you)效連接系(xi)(xi)統十分有(you)必要，該(gai)系(xi)(xi)統在(zai)變(bian)(bian)(bian)異(yi)體(ti)重新(xin)(xin)分類時可對受影響病(bing)例進行檢索(suo)。
聲明31：為了管理疾病變異體，實驗室必須建立本地變量數據庫，為不同疾病的檢測提供臨床依據。
六、研究和診斷之間的區別
隨著全基因組測序在(zai)研(yan)(yan)究(jiu)和診(zhen)斷領域的(de)(de)可(ke)能(neng)性增加，兩者之間的(de)(de)界線也越(yue)來越(yue)模糊，因此(ci)描(miao)述對患者診(zhen)斷數據(ju)的(de)(de)用途以(yi)及(ji)確定特定類型的(de)(de)分析研(yan)(yan)究(jiu)是必(bi)要的(de)(de)。然(ran)而，這并不排(pai)除對診(zhen)斷結果進一步研(yan)(yan)究(jiu)的(de)(de)建議，但研(yan)(yan)究(jiu)與(yu)診(zhen)斷之間的(de)(de)區別必(bi)須時刻保持清晰。
聲明32：任何診斷測試都是為了回答與患者醫療條件相關的臨床問題。
聲明33：研究測試是一種驅動假設，結果可能僅限于參與研究的患者的臨床效應。
聲明34：通過分析外顯子或基因組得出的診斷測試結果可假設生成。
在(zai)診斷(duan)過程(cheng)中，使用NGS技術獲得的外(wai)顯子測序和基(ji)因(yin)組數據是(shi)可以接受的，如果目標是(shi)獲得一個遺傳診斷(duan)那么檢測將局(ju)限于與該(gai)疾病相關的已知基(ji)因(yin)。
聲明35：當以單一患者的診斷為的目的診斷檢測應在獲認可的實驗室中進行。
當參與(yu)一個(ge)研究(jiu)項目時，患者及其(qi)家庭必(bi)須意識(shi)到這(zhe)個(ge)項目可(ke)能會披露其(qi)遺傳(chuan)性疾病(bing)的(de)(de)信息。在研究(jiu)中，臨床相關的(de)(de)結(jie)果必(bi)須在診斷確定后才能納入(ru)患者的(de)(de)醫(yi)療記錄中。
聲明36：研究結果必須在通過認證的實驗室確定后方可轉移至患者身上。
大多數(shu)實驗室都(dou)建立本(ben)地(di)測(ce)序/分(fen)析(xi)樣本(ben)變(bian)異頻率(lv)數(shu)據庫以便易于(yu)(yu)進行變(bian)異解釋。這(zhe)類數(shu)據庫不(bu)包含任何敏(min)感的信息(xi)。出于(yu)(yu)隱私原則考慮，不(bu)掂量這(zhe)些(xie)數(shu)據對診斷和醫(yi)療改善的重要(yao)性。
聲明37：所有來自健康個體的診斷測試或研究測試的變異頻率都應共享。
理想情況下，疾(ji)病檢測(ce)中所(suo)有與基因相關的變(bian)體應(ying)該提交至致病性變(bian)異數據庫，并與患(huan)者的臨床數據相結合。用于變(bian)異體分(fen)類的標準和參數應(ying)清楚描述(shu)。
